出口木箱可按材质、承载重量及结构进行分类。

按材质主要分为胶合板木箱（免熏蒸木箱）与实木木箱。胶合板木箱采用符合出口要求的免检板材（如9mm-15mm厚度的复合板或胶合板）制成，此材料制成的包装箱不需要办理熏蒸手续即可出口，一般用于5吨以下设备的包装。实木木箱采用原木木方和木板制成，一般用于5吨以上设备，其抗压力和承载力通常大于胶合板木箱。原木制作的木箱必须经过熏蒸或热处理等检疫除害处理，并加施IPPC标志、出具官方熏蒸证书，才能符合出口要求。木质包装熏蒸是为防止有害病虫危害进口国森林资源所采取的强制措施，主要针对输往美国、加拿大、欧盟、日本及澳大利亚等国家的货物，其中对美国、加拿大必须出具官方熏蒸证书 。

按承载重量可分为大型木箱包装与小型木箱包装。大型木箱包装内装物在500kg或以上，主要应用于大型机电设备、仪表柜等包装。小型木箱包装内装物在500kg以下，主要应用于小型机电设备、五金零部件、电子元件、卫生洁具、家用电器等包装。

按结构可分为钉板箱、条板箱、捆板箱、木撑合板箱、榫接木箱及框架组合木箱。钉板箱具有机械强度大、抗冲击性能好、能耐较大的堆积载荷并可码高垛的特点，一般用作小型运输包装。条板箱通风透气、结构坚固强度高、能承受较大的码垛载荷并节省材料，常用于需要通风的货物、易碎物品或大型设备包装。捆板箱能折叠，节省存放空间，一般用于纸箱集装和果蔬类物品的外包装。木撑合板箱承载能力与钉板箱相近，但重量更轻、箱面平滑、防尘性能较好且便于印刷标记。榫接木箱木板较厚、表面刨光、外形美观，主要用于包装仪器、仪表等高级商品。框架组合木箱是一种装配式木箱，用于包装重型货物，货物重量可达10～15吨。